Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms