Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ca13Q9D6N1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca13Q9D6N1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ca13Q9D6N1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca13Q9D6N1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca13Q9D6N1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca13Q9D6N1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca13Q9D6N1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms