Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Fam227bQ9D518 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Fam227bQ9D518 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Fam227bQ9D518 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Fam227bQ9D518 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Fam227bQ9D518 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Fam227bQ9D518 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Fam227bQ9D518 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Fam227bQ9D518 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam227bQ9D518 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam227bQ9D518 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Fam227bQ9D518 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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