Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrameQ9D4Z5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms