Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931428L18RikQ9D4S9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms