Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sohlh2Q9D489 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sohlh2Q9D489 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms