Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp35Q9D384 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp35Q9D384 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms