Protein–RNA interactions for Protein: Q9D328

Tmem35a, Transmembrane protein 35A, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35aQ9D328 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35aQ9D328 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem35aQ9D328 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms