Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l4Q9D2A5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l4Q9D2A5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms