Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms