Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TbcbQ9D1E6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TbcbQ9D1E6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms