Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prelid3bQ9CYY7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prelid3bQ9CYY7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms