Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrs1Q9CYH6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrs1Q9CYH6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms