Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mis12Q9CY25 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mis12Q9CY25 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms