Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Yif1bQ9CX30 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Yif1bQ9CX30 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms