Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx10Q9CWT3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx10Q9CWT3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms