Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot11Q9CWN7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot11Q9CWN7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot11Q9CWN7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot11Q9CWN7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Cnot11Q9CWN7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Cnot11Q9CWN7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot11Q9CWN7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Cnot11Q9CWN7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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Cnot11Q9CWN7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot11Q9CWN7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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