Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raver1Q9CW46 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raver1Q9CW46 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms