Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud1Q9CUB6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud1Q9CUB6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms