Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mri1Q9CQT1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mri1Q9CQT1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms