Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms