Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim11Q99PQ2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim11Q99PQ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim11Q99PQ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms