Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms