Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brms1Q99N20 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brms1Q99N20 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms