Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac9Q99N13 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hdac9Q99N13 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms