Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrrtQ99MR6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms