Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rwdd2bQ99M03 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms