Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpifQ99KR7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpifQ99KR7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms