Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab28Q99KL7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rab28Q99KL7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab28Q99KL7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms