Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims1Q99JW4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms