Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf112Q96DY5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf112Q96DY5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms