Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim59Q922Y2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms