Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Afg3l1Q920A7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Afg3l1Q920A7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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