Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx18Q91ZR2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms