Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm2Q91YD4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm2Q91YD4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms