Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcdhb12Q91Y07 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms