Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc18Q8VD24 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc18Q8VD24 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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