Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy2Q8R4C2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms