Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg10Q8R1P4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg10Q8R1P4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms