Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Hecw1Q8K4P8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms