Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lin28aQ8K3Y3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin28aQ8K3Y3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms