Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms