Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Paf1Q8K2T8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Paf1Q8K2T8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms