Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1eQ8K202 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms