Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
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