Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkn3Q8K045 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkn3Q8K045 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkn3Q8K045 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkn3Q8K045 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkn3Q8K045 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms