Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SltmQ8CH25 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SltmQ8CH25 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SltmQ8CH25 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SltmQ8CH25 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SltmQ8CH25 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SltmQ8CH25 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms