Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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