Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC12

Cdan1, Codanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdan1Q8CC12 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdan1Q8CC12 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdan1Q8CC12 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms