Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsr2Q8C8T8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms